数据集概述
本数据集为glis3在斑马鱼腺垂体发育中调控作用研究的补充数据,包含主文及补充材料所有图表对应的原始数值数据。数据记录了glis3敲低(KD)及拯救实验对垂体细胞分化、下丘脑-垂体功能及渗透压调节的影响,采用Student-t检验或Mann-Whitney检验进行统计分析,显著结果标注为红色。
文件详解
- 文件名称:Supporting Data_Rurale et al.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:文件包含按主文图表(Fig.1-4)和补充图表(Supplementary Fig.1、Supplementary Table1-5)命名的子文件夹/工作表,对应内容如下:
- 原位杂交染色面积量化:24 hpf胚胎nkx2.2a、pax7等基因的整体原位杂交染色像素面积
- qRT-PCR基因表达量化:不同发育时间点(24、26、30、33、36、60、120 hpf)CTRL、glis3KD及拯救组胚胎/幼鱼的mRNA表达水平(ddCT法归一化)
- 荧光原位杂交体积量化:pit1、prl等基因在不同时间点的荧光杂交体积(单位:um³)
- 细胞计数:tshba、prl等阳性细胞数量(共聚焦z-stack手动计数)
- ELISA检测:120 hpf幼鱼催乳素(prl)浓度(单位:ng/ml)
- 免疫荧光强度量化:催乳素在鳃、胸鳍等组织的平均荧光强度(MFI)
- 表型观察:腹部水肿频率、Rhodamine B-dextran排泄/保留频率
- 引物列表:qRT-PCR及WISH/FISH探针所用引物序列
数据来源
Rurale et al关于glis3调控斑马鱼腺垂体发育的研究
适用场景
- 斑马鱼腺垂体发育机制研究:分析glis3对pit1前体细胞分化的调控作用及时效性
- 下丘脑-垂体轴功能分析:探究glis3敲低对激素基因表达及激素分泌的影响
- 渗透压调节机制研究:评估glis3对斑马鱼渗透压平衡相关基因表达及表型的作用
- 基因功能拯救实验验证:验证glis3拯救策略对敲低表型的恢复效果
- 发育生物学实验方法参考:借鉴原位杂交量化、qRT-PCR归一化等实验方法及统计分析流程