数据集概述
本数据集包含GMXPBSA 2.1工具相关文件，该工具是基于Bash/Perl脚本的套件，用于简化GROMACS轨迹衍生结构的MM/PBSA计算，自动计算蛋白质-蛋白质或配体-蛋白质复合物的结合自由能，是GMXPBSA 2.0的改进版本。
文件详解
- 压缩包文件：
- 文件名称：aetq_v1_1.tar.gz
- 文件格式：GZ压缩包（.gz）
- 内容说明：可能包含GMXPBSA 2.1工具的核心脚本、程序代码及相关资源文件
- 补充材料文件（位于SupplementaryMaterial/目录下）：
- 文件名称：Table.pdf
- 文件格式：PDF（.pdf）
- 内容说明：可能包含工具相关的补充表格数据，如计算参数、结果示例或验证数据
数据来源
Queen's University Belfast CPC Program Library (1969-2018)
适用场景
- 计算结构生物学研究：用于分析蛋白质-配体或蛋白质-蛋白质复合物的结合自由能
- 药物研发辅助：支持基于分子动力学轨迹的配体结合亲和力预测
- 蛋白质工程研究：通过计算丙氨酸扫描探究关键残基对复合物稳定性的影响
- 计算模拟方法优化：验证MM/PBSA计算流程在GROMACS轨迹数据中的应用效果
