Gochnatieae_Based_菊科Gochnatieae族系统发育基因组数据_2021

数据集概述

本数据集为菊科Gochnatieae族系统发育基因组研究数据,包含用于界定该族属级分类边界、提升Moquiniastrum属物种级分辨率的系统发育基因组位点数据,以及祖先性状状态重建、祖先区域重建相关参数文件,共47个文件,支持植物分类学与进化生物学分析。

文件详解

  • 多序列比对文件(FASTA格式)
  • 文件名称:遵循filtered_*_MAFFT.fasta模式(如filtered_P2-4_D2_MAFFT.fasta
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:包含经过过滤的系统发育基因组位点多序列比对数据,用于构建系统发育树
  • 系统发育分析文件(XML格式)
  • 文件名称:42_Concat_14June2021.xml
  • 文件格式:XML
  • 字段映射介绍:系统发育分析相关的串联数据文件
  • 祖先性状状态重建参数文件(CSV格式)
  • 文件名称:Char_Final3.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段映射介绍:包含样本(Sample)、有性系统(Sexual_System)、头状花序类型(Capitulum_Type)、花冠类型(Corolla_Type)、边缘雌花(Marginal_Female)等性状数据字段
  • 祖先区域重建参数文件(CSV格式)
  • 文件名称:Dist_Areas_2022.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段映射介绍:包含样本编号、物种名称、区域代码等祖先区域重建相关参数
  • 说明文档(MD格式)
  • 文件名称:README.md
  • 文件格式:MD
  • 字段映射介绍:包含数据集描述、文件结构说明及数据来源DOI链接

数据来源

Dryad数据仓库(DOI: 10.5061/dryad.9ghx3ffj6)

适用场景

  • 植物分类学研究:用于界定菊科Gochnatieae族的属级分类边界,明确该族包含的属类群
  • 物种系统发育分析:提升Moquiniastrum属物种级系统发育分辨率,解析物种间亲缘关系
  • 祖先性状进化研究:基于Char_Final3.csv分析Gochnatieae族生殖相关性状的祖先状态与演化模式
  • 生物地理学分析:利用Dist_Areas_2022.csv开展Gochnatieae族的祖先区域重建,探究其地理起源与扩散路径
  • 植物性系统进化研究:以Moquiniastrum属为模型,分析植物性系统的演化机制
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 4.4 MiB
最后更新 2026年1月12日
创建于 2026年1月12日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。