数据集概述
本数据集为菊科Gochnatieae族系统发育基因组研究数据,包含用于界定该族属级分类边界、提升Moquiniastrum属物种级分辨率的系统发育基因组位点数据,以及祖先性状状态重建、祖先区域重建相关参数文件,共47个文件,支持植物分类学与进化生物学分析。
文件详解
- 多序列比对文件(FASTA格式)
- 文件名称:遵循
filtered_*_MAFFT.fasta模式(如filtered_P2-4_D2_MAFFT.fasta)
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含经过过滤的系统发育基因组位点多序列比对数据,用于构建系统发育树
- 系统发育分析文件(XML格式)
- 文件名称:
42_Concat_14June2021.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:系统发育分析相关的串联数据文件
- 祖先性状状态重建参数文件(CSV格式)
- 文件名称:
Char_Final3.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含样本(Sample)、有性系统(Sexual_System)、头状花序类型(Capitulum_Type)、花冠类型(Corolla_Type)、边缘雌花(Marginal_Female)等性状数据字段
- 祖先区域重建参数文件(CSV格式)
- 文件名称:
Dist_Areas_2022.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含样本编号、物种名称、区域代码等祖先区域重建相关参数
- 说明文档(MD格式)
- 文件名称:
README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:包含数据集描述、文件结构说明及数据来源DOI链接
数据来源
Dryad数据仓库(DOI: 10.5061/dryad.9ghx3ffj6)
适用场景
- 植物分类学研究:用于界定菊科Gochnatieae族的属级分类边界,明确该族包含的属类群
- 物种系统发育分析:提升Moquiniastrum属物种级系统发育分辨率,解析物种间亲缘关系
- 祖先性状进化研究:基于
Char_Final3.csv分析Gochnatieae族生殖相关性状的祖先状态与演化模式
- 生物地理学分析:利用
Dist_Areas_2022.csv开展Gochnatieae族的祖先区域重建,探究其地理起源与扩散路径
- 植物性系统进化研究:以Moquiniastrum属为模型,分析植物性系统的演化机制