数据集概述
本数据集聚焦构巢曲霉的气传基因型互作间接遗传效应（G×G IGEs），通过野生分离株、实验室菌株及突变积累系，量化直接与间接遗传效应对菌丝生长速率的影响，揭示G×G IGEs占表型变异的11%，为微生物进化与应用遗传学研究提供数据支持。
文件详解
- 数据文件（.csv格式）：
- DataRode_et_al2017.csv：菌丝生长率数据，含PlateID（平板标识）、Strain（焦点菌株）、HCgp（异核体兼容组）、MA（突变积累状态）、Stack（堆叠标识）、Position（堆叠位置）等字段
- GbyGGenotypicValues20170113.csv：基因型互作值数据，含coefSS（效应系数）、Strain（菌株）、NeighbStrain（邻株）、HCgp_HCgpNeighbStrain（兼容组互作）等字段
- DGEGenotypicValues20170113.csv：直接遗传效应值数据，含Strain（菌株）、BLUP（最佳线性无偏预测）、VARBLUP（方差）、StrainMAorJC（菌株类型）等字段
- 分析代码与报告（.R、.Rmd、.html格式）：
- Mixed_Model_Analyses.Rmd/.html：混合模型分析代码与报告
- PowerAnalyses.Rmd/.html：功效分析代码与报告
- SimulFigS4new.R/SimulFigS5new.R：模拟图生成代码
- 说明文档（.txt格式）：
- README_for_DataRode_et_al2017.txt：数据集说明文件
适用场景
- 微生物遗传学研究：分析基因型互作间接遗传效应的进化意义
- 应用遗传学实践：指导植物育种中品种混合选择策略
- 群体遗传学分析：探究亲缘选择与亲缘竞争中的遗传互作机制
- 微生物表型变异研究：解析气传社交互作对菌丝生长的影响机制
