数据集概述
本数据集聚焦G蛋白偶联受体(GPCR)药物靶点的药物基因组学研究,包含基因、蛋白相关原始数据与样本信息,覆盖受体变异、药物结合位点、样本实验数据等内容,为分析遗传变异对药物反应的影响提供数据支持。
文件详解
- 核心数据文件(CSV格式,共13个):
- arrestin_contacts.csv:记录受体与arrestin蛋白的接触位点数据,字段包括EntryName(蛋白名称)、Residue(残基)、Segment(结构区域)、PDB(蛋白结构数据库ID)等
- generic_LB_site.csv:通用配体结合位点数据(具体字段未完整预览)
- ExAC_GPCRs_raw.csv:ExAC数据库中GPCR原始变异数据(具体字段未完整预览)
- classA_gprotein_contacts.csv:A类GPCR与G蛋白的接触位点数据(具体字段未完整预览)
- GPCRdb_mutation_raw.csv:GPCRdb数据库中的原始突变数据(具体字段未完整预览)
- NHS_raw.csv:NHS相关原始数据(具体字段未完整预览)
- PTM_gpcrs.csv:GPCR翻译后修饰数据(具体字段未完整预览)
- 样本与基因信息文件:
- Genome1K_samplesinfo.tsv:1000基因组样本信息表(TSV格式)
- EST_ENSG_GENE.csv:EST、ENSG基因ID映射数据,字段包括ENST(转录本ID)、ENSG(基因ID)、EntryName(蛋白名称)、gene(基因名)、Uniprot(蛋白数据库ID)
- 文本数据文件(TXT格式,共3个):
- denovo_mutations.txt:新生突变数据,字段包括SampleID(样本ID)、StudyName(研究名称)、Position(基因组位置)、Variant(变异类型)、rsID(SNP数据库ID)等
- allelicexp_genes.txt:等位基因表达相关基因列表(具体内容未完整预览)
- VEP_rsIDs.txt:VEP注释的rsID列表(具体内容未完整预览)
- 压缩文件:
- Supplementary Tables.zip:补充表格压缩包(ZIP格式)
适用场景
- 药物基因组学研究:分析GPCR遗传变异对药物反应的影响机制
- 临床精准医疗:探究受体变异与药物不良反应的关联,辅助精准处方
- 分子生物学实验:验证药物靶点受体变异的功能效应
- 公共卫生研究:评估遗传因素导致的药物反应差异对社会经济的影响