GPCR药物靶点药物基因组学数据集

数据集概述

本数据集聚焦G蛋白偶联受体(GPCR)药物靶点的药物基因组学研究,包含基因、蛋白相关原始数据与样本信息,覆盖受体变异、药物结合位点、样本实验数据等内容,为分析遗传变异对药物反应的影响提供数据支持。

文件详解

  • 核心数据文件(CSV格式,共13个):
  • arrestin_contacts.csv:记录受体与arrestin蛋白的接触位点数据,字段包括EntryName(蛋白名称)、Residue(残基)、Segment(结构区域)、PDB(蛋白结构数据库ID)等
  • generic_LB_site.csv:通用配体结合位点数据(具体字段未完整预览)
  • ExAC_GPCRs_raw.csv:ExAC数据库中GPCR原始变异数据(具体字段未完整预览)
  • classA_gprotein_contacts.csv:A类GPCR与G蛋白的接触位点数据(具体字段未完整预览)
  • GPCRdb_mutation_raw.csv:GPCRdb数据库中的原始突变数据(具体字段未完整预览)
  • NHS_raw.csv:NHS相关原始数据(具体字段未完整预览)
  • PTM_gpcrs.csv:GPCR翻译后修饰数据(具体字段未完整预览)
  • 样本与基因信息文件:
  • Genome1K_samplesinfo.tsv:1000基因组样本信息表(TSV格式)
  • EST_ENSG_GENE.csv:EST、ENSG基因ID映射数据,字段包括ENST(转录本ID)、ENSG(基因ID)、EntryName(蛋白名称)、gene(基因名)、Uniprot(蛋白数据库ID)
  • 文本数据文件(TXT格式,共3个):
  • denovo_mutations.txt:新生突变数据,字段包括SampleID(样本ID)、StudyName(研究名称)、Position(基因组位置)、Variant(变异类型)、rsID(SNP数据库ID)等
  • allelicexp_genes.txt:等位基因表达相关基因列表(具体内容未完整预览)
  • VEP_rsIDs.txt:VEP注释的rsID列表(具体内容未完整预览)
  • 压缩文件:
  • Supplementary Tables.zip:补充表格压缩包(ZIP格式)

适用场景

  • 药物基因组学研究:分析GPCR遗传变异对药物反应的影响机制
  • 临床精准医疗:探究受体变异与药物不良反应的关联,辅助精准处方
  • 分子生物学实验:验证药物靶点受体变异的功能效应
  • 公共卫生研究:评估遗传因素导致的药物反应差异对社会经济的影响
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 27.14 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。