数据集概述
本数据集为Herzog等人2017年发表于《Nature Methods》的研究中，小鼠胚胎干细胞（mESCs）经4sU处理24小时后的GRAND-SLAM分析结果，包含处理管道输出、运行脚本、映射读数等数据，支持重新生成分析结果。
文件详解
- ameres_24h.tsv.gz
- 文件格式：TSV.GZ
- 字段映射介绍：GRAND-SLAM输出表，包含基因测序分析的核心结果数据
- ameres_24h.json
- 文件格式：JSON
- 字段映射介绍：包含datasets、references、nosoft、starparam等键值对，用于从初始步骤启动分析流程
- ameres_24h.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：处理管道的完整输出压缩包，包含映射读数、运行脚本及输出结果
数据来源
Herzog et al., Nature Methods 2017（https://doi.org/10.1038/nmeth.4435）
适用场景
- 基因表达动态研究：分析mESCs经4sU处理后的转录组变化及RNA代谢特征
- 测序数据分析流程复现：基于JSON文件和脚本，复现GRAND-SLAM分析的完整流程
- 生物信息学工具验证：测试GRAND-SLAM、STAR等工具在特定实验数据中的性能
- 干细胞转录组调控机制研究：结合测序结果，探究mESCs基因表达调控的分子机制
