GTEx_V6p联盟数据中43583个人类外显子的包含情况数据集

数据集概述

该数据集记录了GTEx V6p联盟数据中43583个人类外显子在52种组织及亚组织中的包含情况,重点关注重复序列衍生外显子(Alu或LINE重复序列来源剪接位点)的包含比例,数据基于hg19基因组版本,采用0碱基位置标注。

文件详解

  • 文件名称: TableS6_GTEx_inclusionLevels.tab
  • 文件格式: .tab(制表符分隔文本格式)
  • 核心内容: 包含43583个人类外显子在52种组织中的包含水平数据,涉及重复序列衍生外显子(Alu/LINE来源剪接位点)与同基因其他外显子的量化结果,基于hg19基因组的0碱基位置信息。

适用场景

  • 基因组学研究: 分析人类外显子在不同组织中的可变剪接模式及包含水平差异
  • 重复序列功能研究: 探究Alu、LINE等重复序列衍生外显子的组织特异性表达特征
  • 转录组学分析: 辅助研究GTEx数据中基因表达调控与外显子包含率的关联机制
  • 生物信息学方法验证: 作为基准数据测试外显子包含水平量化算法的准确性
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 5.49 MiB
最后更新 2025年11月29日
创建于 2025年11月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。