数据集概述
本数据集包含蓝细菌光系统I（PDB编号1JB0）全部96个叶绿素位点能量计算结果，基于全原子三聚体膜嵌入模型，通过分子动力学轨迹采样40个构象快照，结合QM/MM计算和DFT/MRCI方法，考虑热波动、自然环境静电效应及叶绿素激发的多参考特性，揭示天线复合物中能量漏斗的形成机制。
文件详解
- 文件名称：supplementary_data_v1.1.1.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 字段映射介绍：压缩包包含v1.0.0和v1.1.0版本数据，v1.0.0含每个快照中各叶绿素的位点能量、位点能量偏移、吸收光谱（含/不含环境点电荷）、结构文件及力场参数；v1.1.0新增反应中心叶绿素快照、统计分析结果及点偶极近似下的激子耦合数据。
适用场景
- 光合系统能量传递机制研究：分析光系统I中叶绿素位点能量的热波动对能量漏斗形成的影响。
- 生物物理计算方法验证：评估QM/MM、DFT/MRCI等方法在光合系统位点能量计算中的适用性。
- 光合系统结构与功能关系分析：探究膜嵌入环境、构象变化对叶绿素激发特性的调控作用。
- 光合系统热适应机制研究：揭示生理温度下能量传递路径的瞬时形成规律及热波动对能量壁垒的影响。
