数据集概述
本数据集来自关于马达加斯加安达西贝地区植食性蛙类(Guibemantis属)的研究论文,包含该区域两栖动物热点的物种多样性、共现模式及新物种描述相关数据,涉及基因序列、测量数据、音频记录等12个文件,支持两栖动物分类与生态研究。
文件详解
- 序列与测量数据文件
- 文件名称:Pandanusicola_sequences_measurements_Zenodo_21Oct2023.xlsx、TaxI2_Pandanusicola_16S_pdistances.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含植食性蛙类的基因序列数据、测量数据及遗传距离分析结果
- 序列比对文件
- 文件名称:16S_alignment_forMolD_and_TAXI2_new.tsv、16S_alignment_forMolD_with_Mantella_reference_aligned_trimmed.fas、ASAP_Pandanusicola_16S_aligned_trimmed_20230502T090610.fas
- 文件格式:TSV、FAS
- 字段映射介绍:包含seqid(序列ID)、species(物种)、sequence(基因序列)等字段,记录16S rRNA基因比对结果
- 音频文件
- 文件名称:Guibemantis_ambakoana_Ca3_Torotorofotsy.wav、Guibemantis_ambakoana_Ca3_Andasibe.wav、Guibemantis_methueni_Andasibe.wav、Guibemantis_vakoa_Ca8_Besariaka.wav、Guibemantis_rianasoa_Ca14_Andasibe.wav等
- 文件格式:WAV
- 字段映射介绍:记录不同Guibemantis物种的鸣声音频数据
- 可视化与分析文件
- 文件名称:ASAP_16S_subsets.svg
- 文件格式:SVG
- 字段映射介绍:16S基因子集分析结果的可视化图表
数据来源
论文“Unexpected diversity and co-occurrence of phytotelmic frogs (Guibemantis) around Andasibe, one of the most intensively surveyed amphibian hotspots of Madagascar, and descriptions of three new species”
适用场景
- 两栖动物物种多样性研究: 分析马达加斯加安达西贝地区植食性蛙类的物种组成与分布模式
- 生物声学研究: 利用WAV音频文件研究Guibemantis属蛙类的鸣声特征及物种鉴定
- 分子系统学分析: 通过16S基因序列数据探究植食性蛙类的亲缘关系与分类地位
- 生物多样性热点监测: 为两栖动物热点区域的物种调查与保护提供基础数据支持