数据集概述
本数据集围绕硅藻叶绿体蛋白编码基因的系统发育信号与噪声分析展开，包含六个核心基因（atpB、psaA、psaB、psbA、psbC、rbcL）的实验数据与分析结果，验证了基因串联对信号提取的有效性，为硅藻系统发育研究提供数据支持。
文件详解
- 数据文件：
- Theriot.etal.July2014.diatom.7gene.data.with.all.charsets.nex：NEX格式数据文件，包含7个基因的系统发育分析数据集及字符集定义
- 表格文件：
- Table.S1.Taxa.GenbankNumbers.xlsx：Excel格式，记录研究涉及的分类单元及其GenBank编号
- Table.S2.PrimerTable.docx：Word格式，引物信息表
- Table.S3.EntropyTest.docx：Word格式，熵测试结果表
- Table.S4.CDCSummary.docx：Word格式，CDC分析汇总表
- Table.S5.pC.pI.pP.byGene.v2.docx：Word格式，按基因分组的pC、pI、pP值表
- Table.S6.pC.pI.pP.byPosition.docx：Word格式，按密码子位置分组的pC、pI、pP值表
- 图片文件：
- Fig.S1.SaturationPlot.psaA3.pdf：PDF格式，psaA基因第3密码子位置的饱和曲线图
- Fig.S2.7gene.full.pdf：PDF格式，7基因完整分析结果图
- Fig.S3.cplastonly.pdf：PDF格式，仅叶绿体基因分析结果图
- Fig.S4.ssuonly.pdf：PDF格式，仅SSU基因分析结果图
适用场景
- 分子系统发育研究：分析硅藻叶绿体基因的系统发育信号与噪声特征
- 进化生物学分析：探究密码子位置对系统发育信号的贡献差异
- 生物信息学方法验证：验证信息谱分析、分区Bremer支持等方法在系统发育研究中的应用价值
- 硅藻分类学研究：为硅藻系统发育关系重建提供分子数据支持
