数据集概述
本数据集围绕古菌中M42家族氨肽酶(TET)的多样性、功能特性及进化历史展开,包含序列数据、系统发育树、补充表格及实验记录文件,为研究TET酶的分类、底物特异性及进化路径提供支持。
文件详解
该数据集包含多个文件,具体说明如下:
- 序列数据文件:
- TETSeq_AllArchaea.faa: 所有古菌TET酶的氨基酸序列文件(faa格式)
- TETSeq_ReducedArchaea_Bacteria.faa: 古菌与细菌的简化TET酶氨基酸序列文件(faa格式)
- 系统发育树文件:
- TETSeq_AllArchaea.treefile: 基于所有古菌TET序列构建的系统发育树文件
- TETSeq_ReducedArchaea_Bacteria.treefile: 基于古菌与细菌简化TET序列构建的系统发育树文件
- 补充表格文件:
- Supp_Table_S1.xlsx、Supp_Table_S2.xlsx、Supp_Table_S3.xlsx: 补充表格文件(Excel格式)
- statistical_source_data.xlsx: 统计分析源数据文件(Excel格式)
- 实验记录文件:
- TET-2.txt、TET-3.txt、TET-5.txt、TET-8.txt、TET-9.txt、TET-10.txt等12个txt文件: 包含TET酶的实验记录信息,如菌株来源、分类学信息等
适用场景
- 微生物学研究: 分析古菌TET酶的分类多样性及进化关系
- 酶学功能研究: 探究TET酶的底物特异性、激活条件及功能分化机制
- 生物技术应用: 挖掘具有潜在应用价值的TET酶资源
- 进化生物学研究: 研究TET酶基因复制、水平转移等进化事件对功能多样化的影响