数据集概述
本数据集为Andrew Scott等学者2025年相关论文配套的R分析代码，包含衰老果蝇、仰卧果蝇及秀丽隐杆线虫数据集的分析代码与所需数据文件，支持复现论文中基因聚类、伪时间轨迹拟合等核心分析。
文件详解
该数据集按不同研究对象分目录存储，具体说明如下：
- 衰老果蝇数据集相关文件（1_Required_data_files_for_Aging_Fly_Dataset/）：
- 数据文件：如sample_info.txt（样本信息）、information_for_genes_for_clustering.txt（聚类基因信息）
- R代码文件：如1a_Rcode_Core_Analysis_Aging_Fly_Dataset.txt（核心分析代码）、1b_Rcode_Age_Marker_Selection_Analysis_Aging_Fly_Dataset.txt（年龄标记选择分析代码）
- 仰卧果蝇数据集相关文件（2_Required_data_files_for_Supine_Fly_Dataset/）：
- 数据文件：如info.txt（参数信息）、pseudo_time_prior_data.txt（伪时间先验数据）
- R代码文件：如2a_Rcode_Core_Analysis_Supine_Fly_Dataset.txt（核心分析代码）
- 秀丽隐杆线虫数据集相关文件（3_Required_data_files_for_C_elagans_Dataset/）：
- 数据文件：如working_data.txt（工作数据集）
- 所有文件格式均为.txt，共六十四份文件
适用场景
- 果蝇死亡分子机制复现研究：复现论文中关于果蝇死亡过程离散分子事件的分析
- 生物信息学方法应用：学习基因聚类、伪时间轨迹拟合等分析方法的R代码实现
- 衰老相关基因表达分析：基于数据集探索衰老果蝇的基因表达变化规律
- 跨物种死亡机制对比：结合秀丽隐杆线虫数据开展多物种死亡过程的比较研究
