数据集概述
本数据集围绕特立尼达孔雀鱼(Poecilia reticulata)的视觉系统与配偶偏好展开,包含7个文件,涵盖环境参数、基因表达、基因多态性频率及统计分析代码等内容,用于研究不同捕食压力环境下孔雀鱼视觉基因(如LWS视蛋白)的表达差异与配偶偏好的关联,验证感官剥削理论。
文件详解
- Trinidad Environment.csv(CSV格式):包含流域、种群、捕食压力、温度、电导率、溶解氧等环境参数
- Ala:Ser 180 Frequency.xlsx(XLSX格式):记录LWS视蛋白编码多态性(Ala/Ser 180)在不同种群中的频率数据
- RelHouseFinal.txt(TXT格式):包含样本性别、体长、种群、流域、捕食压力等信息,以及Bactin、COI、LWS1、LWS3等基因的相对表达量数据
- lambdaP50.csv(CSV格式):记录不同捕食压力和流域下孔雀鱼的视觉灵敏度峰值波长数据
- LWS seq2.txt(TXT格式):LWS视蛋白基因序列相关数据
- RelOpsinFinal.txt(TXT格式):视蛋白基因(如RH1、RH21、SWS1等)的相对表达量数据
- Sandkam et al stats.R(R格式):用于本研究统计分析的R代码文件
数据来源
论文“Beauty in the eyes of the beholders: color vision is tuned to mate preference in the Trinidadian guppy (Poecilia reticulata)”
适用场景
- 进化生物学研究:分析孔雀鱼视觉系统与配偶偏好的协同进化机制
- 感官剥削理论验证:探究视觉系统变异如何驱动配偶偏好差异
- 基因表达分析:研究LWS视蛋白基因表达与捕食压力环境的关联
- 环境适应性研究:分析不同捕食压力环境下孔雀鱼视觉基因的适应性变化
- 统计方法应用:基于R代码复现或扩展本研究的统计分析过程