数据集概述
本数据集为病毒检测方法提供基准，将模拟的H5N1流感序列读数与真实废水宏基因组数据结合，模拟新型H5N1毒株在城市废水中可检测水平的场景。包含总读数约七十一万条，其中H5N1读数占比约百分之零点一六，废水读数占比约百分之九十九点八四，可用于评估病毒检测方法的性能。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称：h5n1_wastewater_demo.fastq.gz
- 文件格式：GZ
- 字段映射介绍：包含H5N1模拟序列与真实废水宏基因组数据结合后的测序读数
- 预期结果文件
- 文件名称：expected_results.json
- 文件格式：JSON
- 字段映射介绍：包含数据集信息、病毒组成、模拟参数等结构化数据
- 说明文件
- 文件名称：README.md
- 文件格式：MD
- 字段映射介绍：数据集概述、组成、来源、目录结构及创建方法等说明内容
数据来源
Global Urban Virome Project、Influenza A virus (A/chicken/Egypt/N19604C/2021(H9N2))
适用场景
- 病毒检测方法评估: 作为基准数据集，测试不同方法对低丰度H5N1毒株的检测灵敏度和特异性
- 废水病毒监测研究: 模拟真实城市废水病毒多样性场景，支持废水病毒监测技术研发
- 宏基因组数据分析: 用于宏基因组数据处理流程的优化与验证
- 公共卫生预警系统开发: 为基于废水的传染病预警系统提供测试数据
