数据集概述
本数据集围绕跳蛛(Habronattus americanus)种群展开,聚焦基因流背景下种群间性展示分化的进化研究。包含16个文件,涵盖AFLP标记数据、地理与表型距离数据、AMOVA分析输入文件、R语言分析脚本等,用于支撑基因流抑制进化分化的条件探究及相关统计分析。
文件详解
- TXT文件(11个,占比百分之六十八点七五)
- 典型文件:AFLP_scores.txt、ln_geog-distances_P3a.txt、pheno-distances.txt、AMOVA_in.txt
- 内容示例:AFLP_scores.txt包含标记分类信息(如LOW: NOT RUN IN BAYESCAN);ln_geog-distances_P3a.txt记录地理距离数据;pheno-distances.txt为表型距离数据;AMOVA_in.txt用于AMOVA分析输入
- R脚本文件(2个,占比百分之十二点五)
- 文件名称:IBDLowMid.R、MantelLowMid.R
- 功能:用于隔离-by-距离(IBD)分析及Mantel检验的代码实现
- 压缩包文件(2个,占比百分之十二点五)
- 文件名称:Structure.zip、Bayescan.zip
- 内容:推测包含种群结构分析(Structure)及选择压力检测(Bayescan)相关数据或结果
- ARP文件(1个,占比百分之六点二五)
- 文件名称:Arlequin_CO1.arp
- 功能:用于Arlequin软件进行CO1基因数据分析的输入文件
数据来源
论文“Stark sexual display divergence among jumping spider populations in the face of gene flow”
适用场景
- 进化生物学研究:探究基因流背景下跳蛛种群性展示分化的进化机制
- 种群遗传学分析:利用AFLP标记数据研究种群遗传结构与分化程度
- 地理与表型关联分析:通过地理距离与表型距离数据,分析环境与表型分化的关系
- 统计方法应用验证:使用R脚本及相关输入文件,验证隔离-by-距离、Mantel检验等统计方法在种群研究中的应用
- 选择压力检测:通过Bayescan相关数据,检测种群中性展示相关性状的选择压力