数据集概述
本数据集围绕温度扰动对细胞水平宿主-微生物互作的影响展开，核心探究温度如何解释大陆尺度Wolbachia在黑腹果蝇中的流行率。包含基因组、细胞及表型分析数据，支持揭示wMel Wolbachia在宿主卵子发生关键阶段的细胞丰度变化、温度依赖的母系传播变异及相关适应性机制研究。
文件详解
- Readme_Hague_etal_2021_CurrBio.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：数据集说明文档，可能包含实验设计、数据采集方法、文件关联逻辑等背景信息
- 20210313_HB22_Ovary_Temp_Data.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含菌株（strain）、宿主（host）、Wolbachia类型（wolbachia）、温度（temp）、样本（sample）、成像日期（image_date）、区域（region）、CTCF值等字段，记录不同温度下卵巢中Wolbachia的细胞丰度数据
- wMel_titer_F0s_ovaries.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含基因型（genotype）、宿主（host）、Wolbachia类型（wolbachia）、温度（temperature）、生物学重复（bio_rep）、卵巢采样日期（date_ovary）、卵巢内宿主基因Rpl32表达量（Rpl32_ovary）、卵巢内Wolbachia基因wsp表达量（wsp_ovary）等字段，记录亲代卵巢中Wolbachia的滴度数据
- wMel_transmission_final.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：推测包含Wolbachia母系传播效率相关数据，具体字段需结合文件内容确认
- wMel_egg-to-adult_20210420.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：推测包含卵到成虫阶段的相关表型数据（如存活率、发育时间等），具体字段需结合文件内容确认
- 20210611_20C_Ovary_Data.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：推测包含20℃条件下卵巢相关的细胞或分子数据，具体字段需结合文件内容确认
- wMel_titer_F0s.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：推测包含亲代个体中Wolbachia滴度的整体数据（涵盖卵巢及 carcass等组织），具体字段需结合文件内容确认
- I-TASSER_homology_models.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包，推测包含Wolbachia表面蛋白等相关蛋白的同源建模数据
数据来源
论文“Temperature perturbation of cellular host-microbe interactions explains continent-wide endosymbiont prevalence”（Hague_etal_2021_CurrBio）
适用场景
- 宿主-微生物互作机制研究: 分析温度对Wolbachia在果蝇宿主细胞内丰度及传播效率的影响机制
- 内共生菌流行率驱动因素分析: 探究温度依赖的母系传播变异与Wolbachia全球纬度分布格局的关联
- 微生物适应性进化研究: 对比温带与热带Wolbachia变种的冷适应能力差异，解析快速适应性进化的分子基础
- 生物防治策略优化: 基于Wolbachia温度适应性特征，为Wolbachia介导的病媒生物控制提供菌株选择依据
- 宿主-微生物-环境互作建模: 结合数学模型分析GxGxE互作如何调控Wolbachia传播及平衡频率
