数据集概述
本数据集包含支持科学论文《海洋蜗牛物种形成不同阶段的表型分化与基因组结构》的基因组数据与分析脚本，涉及遗传群体信息、SNP位点筛选、PCA分析、空间数据等内容，为研究海洋蜗牛物种形成过程提供基础数据与分析工具。
文件详解
- 说明文档：
- README.txt：TXT格式，提供数据集整体描述、作者信息及关联出版物信息。
- 遗传群体与表型数据：
- CZEA_info_genet_group.txt、info_genet_group.csv：TXT/CSV格式，包含遗传群体分组信息。
- ER_EA_genetic_group_sexe_table.csv：CSV格式，含蜗牛个体ID、遗传群体（如Red）、性别（female/male）字段。
- habitat_vs_BlueRed.csv：CSV格式，可能关联栖息地与表型（Blue/Red）的数据。
- 位点筛选数据：
- CZE_positions_to_keep_1kb_s1.txt、CZE_positions_to_keep_1kb_s3.txt、EA1EA2_positions_to_keep_1kb_s1.txt、EA1EA2_positions_to_keep_1kb_s3.txt：TXT格式，记录不同群体（CZE/EA1EA2）不同筛选条件下保留的SNP位点信息。
- 基因组分析脚本：
- 24.Genomic_analysis_Fst.R、25.PCA_per_inversions_EA.R、26.PCA_EA_CZE_suprow.R、27.PCA_per_inversions_CZE.R：R格式，用于Fst分析、基于倒位的PCA分析等基因组数据分析。
- 倒位与空间数据：
- inv_positions_James_Mol_Ecol.tsv：TSV格式，含染色体连锁群（LG）、倒位起始/终止位置（cM）字段。
- CZE_spatial_LCP_20190523_mod.csv：CSV格式，可能包含CZE群体的空间数据。
- 压缩数据文件：
- CZE_PCAbyMapPos.zip、CZE_only_CZE_SNPs_PCA_per_inversion_data.zip、EA1EA2_PCAbyinversions.zip：ZIP格式，存储PCA分析相关的压缩数据。
适用场景
- 进化生物学研究：分析海洋蜗牛物种形成不同阶段的基因组结构变化。
- 群体遗传学分析：探究遗传群体分化、基因流及选择压力。
- 表型与基因型关联研究：关联表型（如Blue/Red）与基因组位点或倒位区域。
- 生物信息学方法应用：复现或扩展基因组数据分析（如Fst、PCA）流程。
