数据集概述
该数据集记录了海洋细菌群落定殖藻酸盐与果胶混合颗粒的演替过程及CAZyme表达情况，包含宏基因组组装基因组、基因预测结果、转录本丰度数据及DNA/RNA共提取实验方案，为研究海洋细菌群落功能多样性提供支持。
文件详解
- 宏基因组组装与注释文件：
- MetaG_contigs.gb：GB格式，组装后的宏基因组contigs及Prokka注释结果
- 多个Prokka注释的宏基因组组装基因组（MAG）文件：MAG21.gb、MAG_Col-24.gb、MAG_Ten-26.gb（注：文件样本未显示，按描述包含）、MAG_Gla-32.gb、MAG_Psyb-57.gb、MAG_Psym-73.gb，均为GB格式
- 基因预测与翻译文件：
- MetaG_genes.faa：预测基因的氨基酸序列文件
- MetaG_genes.txt：预测基因的摘要信息文件
- MetaG_translations.txt：预测基因的翻译结果文件
- 转录本丰度文件：
- MetaT_raw.csv：原始转录本丰度数据，包含GeneID、Contig等字段及样本表达值
- MetaT_TPM.csv：TPM标准化后的转录本丰度数据，包含GeneID及多个样本的TPM值
- 实验方案文件：
- DNA-RNA_CoExtraction.pdf：PDF格式，DNA与RNA联合提取的实验方案
适用场景
- 海洋微生物生态学研究：分析海洋细菌群落定殖多糖颗粒的演替规律
- 微生物功能基因组学：探究CAZyme基因表达与多糖降解的关联机制
- 宏基因组学方法验证：验证混合多糖环境下宏基因组/宏转录组的分析流程
- 微生物资源开发：挖掘具有多糖降解能力的海洋细菌基因资源
