数据集概述
本数据集围绕Leach's风暴海燕(Oceanodroma leucorhoa leucorhoa)的种群遗传结构与长距离扩散展开研究,包含线粒体控制区序列(103个个体)和核微卫星位点(245个个体)的遗传数据,用于分析大西洋与太平洋种群的连通性及扩散动态,为该物种的保护管理提供科学依据。
文件详解
- 文档类文件(TXT格式,13个)
- 示例文件:README_for_STRUCTURE parameter file with priors.txt、README_for_mtDNA sequences 9 colonies.txt
- 内容:各分析文件的说明文档,包括微卫星数据、线粒体DNA序列、STRUCTURE参数、LAMARC及IMa2分析输入文件的格式与参数说明
- 数据类文件(多格式,7个)
- 微卫星数据:Microsatellite data.txt(TXT格式,含样本ID、名称、 colony位置及等位基因长度数据)、STRUCTURE data file.str(STR格式,用于STRUCTURE分析的微卫星等位基因数据)
- 线粒体DNA数据:mtDNA sequence data.txt(TXT格式)、mtDNA sequences 9 colonies.phy(PHY格式)、IMa2 mtDNA input file.u(U格式)
- 种群遗传学分析文件:LAMARC Pacific sample file.bio、LAMARC Atlantic sample file.bio(BIO格式)、LAMARC Pacific infile.xml、LAMARC Atlantic infile.xml(XML格式)、STRUCTURE parameter file with priors.txt(TXT格式,含STRUCTURE分析参数)
数据来源
论文“Population genetic structure and long-distance dispersal among seabird populations: implications for colony persistence”
适用场景
- 种群遗传学研究:分析Leach's风暴海燕大西洋与太平洋种群的遗传结构、基因流及分化程度
- 保护生物学应用:为该物种的保护管理提供依据,支持多 colony 保护策略的制定
- 分子生态学分析:探究长距离扩散对局部种群衰退的缓解作用,及海洋尺度的种群连通性
- 遗传数据分析方法验证:用于测试AMOVA、FST、ΦST、Bayesian聚类等种群遗传分析方法的应用效果