数据集概述
本数据集为针对KRASG12C抑制剂MRTX849治疗敏感性的CRISPR/Cas9敲除筛选数据，包含约400个KRAS信号通路相关基因的功能研究结果，涉及H358、H2122细胞系的体外实验及H2122异种移植模型的体内实验，覆盖有无MRTX849处理的多组实验场景，共7个文件。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称：Hallin et al CRISPR data README.docx
- 文件格式：DOCX
- 内容说明：提供数据集的整体说明文档
- H2122细胞系体内外实验数据
- 文件名称：S4751_H2122_invitro_invivo_CRISPR_Screen_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射：包含guide labels（向导标签）、guide sequences（向导序列）、NGS guide counts（NGS向导计数）
- 文件名称：S4751_H2122_invitro_invivo_CRISPR_Screen_meta.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射：包含Unique.SAMPLE.ID（样本唯一ID）、Replicate（重复次数）、Sample（样本）、Study_type（研究类型）、Treatment（处理方式）、Time（时间）、Cell.Line（细胞系）、Approx..Num.of.Cells.(10^6)（细胞数量约值，单位：10^6）、Tumor.weight（肿瘤重量）
- H358细胞系体外实验数据
- 文件名称：S4570_H358_invitro_CRISPR_Screen_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射：包含guide labels、guide sequences、NGS guide counts
- 文件名称：S4570_H358_invitro_CRISPR_Screen_meta.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射：包含Unique.SAMPLE.ID、Replicate、Sample、Treatment、Time、Cell.Line、Approx..Num.of.Cells.(10^6)
- H2122细胞系体外实验数据
- 文件名称：S4610_H2122_invitro_CRISPR_Screen_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射：包含guide labels、guide sequences、NGS guide counts
- 文件名称：S4610_H2122_invitro_CRISPR_Screen_meta.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射：包含Unique.SAMPLE.ID、Replicate、Sample、Treatment、Time、Cell.Line、Approx..Num.of.Cells.(10^6)
数据来源
Hallin et al研究团队
适用场景
- 肿瘤治疗靶点研究：分析KRAS信号通路基因对MRTX849治疗敏感性的调控作用
- 癌症药物研发：筛选影响KRASG12C抑制剂疗效的关键基因，为药物优化提供靶点
- 细胞分子机制研究：探究H358、H2122细胞系中KRAS突变癌症的基因功能机制
- 临床前药效评估：通过体内外实验数据评估MRTX849对KRAS突变癌症的治疗潜力
