数据集概述
本数据集围绕马铃薯单倍体诱导机制展开,包含919个候选单倍体和134个杂交后代的基因组特征数据,涉及单倍体诱导系IVP35、IVP101、PL4与四倍体马铃薯杂交后的倍性变化、染色体异常及诱导系DNA残留情况,为解析单倍体诱导的基因组消除机制提供支撑。
文件详解
- 数据文件(Dataset-S1.tsv、Dataset-S2.tsv)
- 文件名称:Dataset-S1.tsv、Dataset-S2.tsv
- 文件格式:TSV
- 字段映射介绍:
- Dataset-S1.tsv:包含CIP_ID、UCD_ID、雌蕊亲本、花粉亲本、Phureja标记表型、非整倍体来源、倍性评估、SNP倍性、基因组诱导系DNA百分比(genomic_hi_perc)及各染色体(chr01-chr06)相关数据
- Dataset-S2.tsv:包含unit、UCD_ID、亲本育种代码、雌蕊亲本、花粉亲本、B1/I1、B2/I2、illumina_id、测序类型、读长、是否在单倍体池、文库信息、测序平台、spot_count等测序相关元数据
- 文档文件(Dataset-S3.docx)
- 文件名称:Dataset-S3.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:未提供具体字段信息,推测为数据集相关说明文档
数据来源
论文“Rare instances of haploid inducer DNA in potato dihaploids and ploidy-dependent genome instability”
适用场景
- 马铃薯单倍体诱导机制研究: 分析单倍体诱导系DNA残留情况,验证基因组消除作为单倍体诱导机制的假说
- 马铃薯倍性基因组不稳定性分析: 探究不同倍性后代(单倍体、三倍体、四倍体)的染色体断裂及非整倍体特征
- 马铃薯遗传育种应用: 为马铃薯单倍体育种技术优化、种质资源创新提供基因组层面的数据支撑
- 植物生殖生物学研究: 研究2x精子在基因组消除中的作用及倍性依赖的染色体稳定性规律