数据集概述
本数据集是HBV整合位点重分析研究的补充表格，基于426对肝癌肿瘤与癌旁非肿瘤样本的已发表数据，使用T2T-CHM13和GRCh38两种人类参考基因组及GRIDSS VIRUSBreakend方法检测整合位点，揭示与肝癌发生相关的潜在新基因座，包含1个文件。
文件详解
- 文件名称：supplementary_table.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含T2T-CHM13_human、T2T-CHM13_hbv、GRCh38_human、GRCh38_hbv、GRCh_human_annotation、meta等工作表，记录不同参考基因组下的HBV整合位点信息、人类基因组注释及元数据。
数据来源
论文“Re-analysis of hepatitis B virus integration sites reveals potential new loci associated with oncogenesis in hepatocellular carcinoma”（DOI: 10.5501/wjv.v12.i3.209）
适用场景
- 肝癌发生机制研究：分析HBV整合位点与癌基因（如TERT、KMT2B）及新潜在基因座（如11q13.3区域CCND1启动子）的关联。
- 病毒整合检测方法评估：对比GRIDSS VIRUSBreakend与HIVID-hg19在HBV整合位点检测中的敏感性与准确性。
- 肝癌分子标志物筛选：挖掘线粒体基因中反复出现的HBV整合位点作为肝癌诊断或预后的潜在标志物。
- 基因组参考数据库应用研究：评估T2T-CHM13与GRCh38在病毒整合位点分析中的差异及优势。
