数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了HE130品系unc-98(su130)X基因线虫的行为实验数据。实验由英国MRC分子生物学实验室完成,采用tierpsy软件追踪,包含线虫在NGM培养基上的运动特征、骨架数据等,支持基因功能与行为关联分析。
文件详解
- 行为特征文件
- 文件名称:
unc-98 (su130)X on food R_2010_08_05__12_48_16___8___7_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含运动轨迹、速度、弯曲度等量化指标
- 原始追踪文件
- 文件名称:
unc-98 (su130)X on food R_2010_08_05__12_48_16___8___7.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:记录实验原始追踪数据,包含26878个分段骨架数据,对应视频帧的线虫形态信息
- 标准化数据压缩包
- 文件名称:
unc-98 (su130)X on food R_2010_08_05__12_48_16___8___7.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:wcon格式的线虫行为数据压缩包,遵循模式生物行为数据交换标准
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析unc-98基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 模式生物行为学分析: 基于轨迹、骨架数据研究线虫在食物环境中的运动模式
- 基因-行为关联分析: 探索基因突变与行为表型的相关性
- 生物信息学工具验证: 用于tierpsy等线虫追踪软件的算法性能评估与优化
- 神经生物学研究: 结合基因背景研究线虫神经系统对行为的调控机制