合成群落中食细菌线虫与捕食性细菌的行为互作数据集

数据集概述

本数据集记录了合成群落中食细菌线虫(秀丽隐杆线虫)与捕食性细菌(黄色粘球菌)的行为互作,以及两者对共同猎物细菌(大肠杆菌、约翰逊黄杆菌)的捕食行为影响,包含实验原始数据、分析代码及说明文档。

文件详解

  • 数据文件(CSV格式,共6个):
  • data_wormAttraction.csv:记录线虫对不同细菌斑块的吸引行为数据,字段包括时间(time)、重复组(replicate)、培养板(plate)、斑块ID(patchID)、是否含黄色粘球菌(myxo)、细菌活性(liveness)、斑块类型(patch)、线虫数量(worms)
  • data_wormAvoidance.csv:记录线虫对含黄色粘球菌斑块的回避行为数据,字段与吸引行为数据类似
  • data_swarmWorms.csv:记录黄色粘球菌在不同线虫密度下的群体游动速率数据
  • data_wormNumber.csv:记录不同实验条件下的线虫数量统计数据
  • data_wormPatch.csv:记录线虫在多细菌斑块区域的分布选择数据
  • data_swarmWormsNumbers.csv:记录黄色粘球菌群体游动速率与线虫数量的关联数据
  • 分析代码文件(Rmd格式,共3个):
  • rmd_wormPatch.Rmd:线虫斑块选择实验的数据分析代码
  • rmd_swarmWormsNumbers.Rmd:黄色粘球菌游动速率与线虫数量关联的分析代码
  • rmd_wormsAvoid.Rmd:线虫回避行为实验的数据分析代码
  • 说明文档(HTML格式,共3个):
  • doc_wormPatch.html:线虫斑块选择实验的结果说明文档
  • doc_swarmWormsNumbers.html:黄色粘球菌游动速率与线虫数量关联的结果说明文档
  • doc_wormsAvoid.html:线虫回避行为实验的结果说明文档
  • 其他文件:
  • README.txt:数据集整体说明文件,包含各数据文件的实验背景介绍
  • doc_wormPatch.html:线虫斑块选择实验的结果说明文档(重复文件)

适用场景

  • 微生物生态研究:分析土壤微生物食物网中不同营养级捕食者的行为互作机制
  • 行为生态学研究:探究线虫与细菌捕食者的种间行为调控规律
  • 群落动态模拟:为构建复杂微生物群落互作模型提供实验数据支持
  • 生物防治应用:评估捕食性细菌对线虫的行为抑制效应,为线虫防治提供参考
  • 进化生物学研究:分析捕食者间行为互作的共进化意义
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 4.63 MiB
最后更新 2025年12月10日
创建于 2025年12月10日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。