数据集概述
本数据集记录了合成群落中食细菌线虫(秀丽隐杆线虫)与捕食性细菌(黄色粘球菌)的行为互作,以及两者对共同猎物细菌(大肠杆菌、约翰逊黄杆菌)的捕食行为影响,包含实验原始数据、分析代码及说明文档。
文件详解
- 数据文件(CSV格式,共6个):
- data_wormAttraction.csv:记录线虫对不同细菌斑块的吸引行为数据,字段包括时间(time)、重复组(replicate)、培养板(plate)、斑块ID(patchID)、是否含黄色粘球菌(myxo)、细菌活性(liveness)、斑块类型(patch)、线虫数量(worms)
- data_wormAvoidance.csv:记录线虫对含黄色粘球菌斑块的回避行为数据,字段与吸引行为数据类似
- data_swarmWorms.csv:记录黄色粘球菌在不同线虫密度下的群体游动速率数据
- data_wormNumber.csv:记录不同实验条件下的线虫数量统计数据
- data_wormPatch.csv:记录线虫在多细菌斑块区域的分布选择数据
- data_swarmWormsNumbers.csv:记录黄色粘球菌群体游动速率与线虫数量的关联数据
- 分析代码文件(Rmd格式,共3个):
- rmd_wormPatch.Rmd:线虫斑块选择实验的数据分析代码
- rmd_swarmWormsNumbers.Rmd:黄色粘球菌游动速率与线虫数量关联的分析代码
- rmd_wormsAvoid.Rmd:线虫回避行为实验的数据分析代码
- 说明文档(HTML格式,共3个):
- doc_wormPatch.html:线虫斑块选择实验的结果说明文档
- doc_swarmWormsNumbers.html:黄色粘球菌游动速率与线虫数量关联的结果说明文档
- doc_wormsAvoid.html:线虫回避行为实验的结果说明文档
- 其他文件:
- README.txt:数据集整体说明文件,包含各数据文件的实验背景介绍
- doc_wormPatch.html:线虫斑块选择实验的结果说明文档(重复文件)
适用场景
- 微生物生态研究:分析土壤微生物食物网中不同营养级捕食者的行为互作机制
- 行为生态学研究:探究线虫与细菌捕食者的种间行为调控规律
- 群落动态模拟:为构建复杂微生物群落互作模型提供实验数据支持
- 生物防治应用:评估捕食性细菌对线虫的行为抑制效应,为线虫防治提供参考
- 进化生物学研究:分析捕食者间行为互作的共进化意义