黑腹果蝇雌雄繁殖适合度双变量全基因组关联研究数据集

数据集概述

该数据集包含黑腹果蝇半克隆系繁殖适合度双变量全基因组关联研究(GWAS)的代码、日志、结果及图表,使用R包“Mulitphen”分析,为昆虫繁殖适合度的遗传机制研究提供数据支持。

文件详解

  • 日志文件(.txt格式):
  • log_multiphen_R_lhm.txt:记录R包加载过程(如MASS、abind等)及分析日志
  • log_sh_multiphen_lhm.txt:Shell脚本运行日志
  • log_multiphen_lhm.txt:GWAS分析主日志
  • 结果文件(.txt格式):
  • resultsJoint.wide.txt:双变量关联分析的宽格式结果数据
  • results_snpsCounts.txt:单核苷酸多态性(SNP)计数统计结果
  • 代码文件:
  • code_multiphen_lhm.R:R语言分析脚本
  • code_drive_multiphen_lhm.sh:驱动分析的Shell脚本
  • 图表文件:
  • plot_multiphen_gwas_lhm.png:GWAS结果可视化图表

适用场景

  • 遗传学研究:分析黑腹果蝇繁殖适合度的遗传位点及雌雄差异
  • 基因组学分析:验证双变量GWAS方法在昆虫遗传研究中的应用
  • 进化生物学:探究繁殖适合度相关基因的进化选择机制
  • 生物信息学:复现或优化基于Mulitphen包的多表型关联分析流程
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 66.75 MiB
最后更新 2025年12月10日
创建于 2025年12月10日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。