数据集概述
该数据集包含用于开发黑麦草属(Lolium spp.)除草剂抗性等位基因特异性环介导等温扩增(AS-LAMP)协议的参考植物基因组DNA(gDNA)色谱图。数据聚焦ALS与ACCase基因的关键抗性突变位点,为设计针对野生型和突变型的LAMP引物提供序列基础,支持除草剂抗性检测方法的建立。
文件详解
该数据集按基因类型分为两个目录,包含10个ABI格式色谱图文件,具体如下:
- 目录:ACCase gene sequences/
- 文件格式:ABI(.ab1)
- 示例文件:GR9.6_ACC5_Rev.ab1、IT620.10_ACC5_Rev.ab1等
- 文件名编码:包含样本来源(IT=意大利、GR=希腊)、群体与植株编号、突变状态及位点信息
- 目录:ALS gene sequences/
- 文件格式:ABI(.ab1)
- 示例文件:IT595.4-ALS5_Rev.ab1、DK47.6_ALS3_For.ab1等
- 文件名编码:包含样本来源(IT=意大利、DK=丹麦)、群体与植株编号、突变状态及位点信息
适用场景
- 分子生物学研究:用于设计和验证黑麦草属除草剂抗性基因的AS-LAMP检测引物
- 农业生物技术应用:开发快速检测田间黑麦草除草剂抗性的分子诊断工具
- 植物抗性机制研究:分析ALS与ACCase基因关键突变位点的序列特征
- 杂草管理策略制定:为农田杂草抗性监测与治理提供技术支持