HeLa_Kyoto细胞深度学习自动标记数据集

数据集概述

本数据集包含通过深度学习工具自动标记的HeLa "Kyoto"细胞显微图像,涵盖明场(BF)、数字相位对比(DPC)、微管蛋白和H2B荧光通道图像,以及对应的细胞核和细胞标记图像,为细胞图像自动标记研究提供基础数据。

文件详解

该数据集包含3个文件,具体说明如下: - 文件名称: training_dataset.zip - 文件格式: ZIP (.zip) - 内容: 包含16位TIFF格式的显微图像文件,涵盖BF、DPC、微管蛋白、H2B荧光通道图像及细胞核/细胞标记图像,图像尺寸为540x540像素(像素大小0.299 nm) - 文件名称: prepare_trainingDataset_cellpose.ijm - 文件格式: ImageJ宏脚本 (.ijm) - 内容: 用于生成标记图像的脚本,通过StarDist(H2B通道)和Cellpose(微管蛋白+H2B通道)分别生成细胞核和细胞标记图像 - 文件名称: AutoLabelling.png - 文件格式: PNG (.png) - 内容: 自动标记流程相关的图片说明

数据来源

基于“HeLa Kyoto cells under the scope”数据集(https://doi.org/10.5281/zenodo.6139958

适用场景

  • 细胞图像分析研究:用于开发和验证基于明场/相位对比图像的细胞自动标记算法
  • 深度学习教育:作为教学案例,展示如何利用StarDist和Cellpose工具生成训练标记
  • 生物医学图像处理:探究自动标记方法在细胞动态监测中的应用潜力
  • 标记策略对比:分析深度学习自动标记与人工标记的可重复性和效率差异
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 722.53 MiB
最后更新 2025年12月20日
创建于 2025年12月20日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。