Helianthus_argophyllus_UV花斑遗传结构研究数据

数据集概述

本数据集围绕向日葵近缘种Helianthus argophyllus的UV花斑遗传结构展开,包含F2作图群体的UV表型数据、QTL定位结果、相关基因列表及分析脚本等,覆盖UV靶心比例和大小的遗传控制机制研究内容,共7个文件。

文件详解

  • 文本文件(TXT)
  • 文件名称:uneak_bash_filters.txt、all_QTL_genes.txt、all4_UVqtl_blastsUniq.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:uneak_bash_filters.txt记录TASSEL 3软件UNEAK流程的基因型过滤bash命令;all_QTL_genes.txt列出QTL区域相关基因;all4_UVqtl_blastsUniq.txt包含UV相关QTL的BLAST比对结果
  • 数据文件(CSV)
  • 文件名称:UVdata_class_dryad.csv、map3all_dryad_phenoUV_FHage.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段映射介绍:UVdata_class_dryad.csv含向日葵UV表型数据(如clip_size、uv.d.cm等);map3all_dryad_phenoUV_FHage.csv包含GBS样本信息、UV花斑指标(uvR、uvD)及开花时间(FHage)等数据
  • 脚本文件(PL)
  • 文件名称:GBS_Fastq_BarcodeAdder_2Enzyme.pl
  • 文件格式:PL
  • 字段映射介绍:用于GBS测序数据的 barcode 添加脚本
  • 压缩文件(ZIP)
  • 文件名称:UVphotos.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含UV光下拍摄的向日葵花部照片

数据来源

论文“The genetic architecture of UV floral patterning in sunflower”

适用场景

  • 植物遗传学研究: 分析向日葵UV花斑的遗传控制机制,探究QTL与表型的关联
  • 分子育种应用: 利用UV花斑相关QTL信息,辅助向日葵作物的分子标记辅助选择
  • 植物-传粉者互作研究: 结合UV花斑表型数据,研究其对传粉者吸引的影响机制
  • 生物信息学分析: 基于基因型过滤脚本、BLAST结果等,优化植物遗传数据分析流程
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 649.12 MiB
最后更新 2026年1月26日
创建于 2026年1月26日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。