数据集概述
本数据集围绕向日葵近缘种Helianthus argophyllus的UV花斑遗传结构展开,包含F2作图群体的UV表型数据、QTL定位结果、相关基因列表及分析脚本等,覆盖UV靶心比例和大小的遗传控制机制研究内容,共7个文件。
文件详解
- 文本文件(TXT)
- 文件名称:uneak_bash_filters.txt、all_QTL_genes.txt、all4_UVqtl_blastsUniq.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:uneak_bash_filters.txt记录TASSEL 3软件UNEAK流程的基因型过滤bash命令;all_QTL_genes.txt列出QTL区域相关基因;all4_UVqtl_blastsUniq.txt包含UV相关QTL的BLAST比对结果
- 数据文件(CSV)
- 文件名称:UVdata_class_dryad.csv、map3all_dryad_phenoUV_FHage.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:UVdata_class_dryad.csv含向日葵UV表型数据(如clip_size、uv.d.cm等);map3all_dryad_phenoUV_FHage.csv包含GBS样本信息、UV花斑指标(uvR、uvD)及开花时间(FHage)等数据
- 脚本文件(PL)
- 文件名称:GBS_Fastq_BarcodeAdder_2Enzyme.pl
- 文件格式:PL
- 字段映射介绍:用于GBS测序数据的 barcode 添加脚本
- 压缩文件(ZIP)
- 文件名称:UVphotos.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含UV光下拍摄的向日葵花部照片
数据来源
论文“The genetic architecture of UV floral patterning in sunflower”
适用场景
- 植物遗传学研究: 分析向日葵UV花斑的遗传控制机制,探究QTL与表型的关联
- 分子育种应用: 利用UV花斑相关QTL信息,辅助向日葵作物的分子标记辅助选择
- 植物-传粉者互作研究: 结合UV花斑表型数据,研究其对传粉者吸引的影响机制
- 生物信息学分析: 基于基因型过滤脚本、BLAST结果等,优化植物遗传数据分析流程