数据集概述
本数据集包含二倍体向日葵属（Helianthus）物种树估计的相关数据，基于37个物种/亚种的103个样本，通过目标富集技术获取170个基因进行系统发育分析。数据涵盖合并与联合分析结果，支持向日葵属三大分支（一年生分支、两个多年生分支）的划分，为研究该属进化、生态过程及形态特征演变提供基础。
文件详解
- 系统发育树文件（.tre/.nwk格式）
- 文件名称：Accession_tree.tre、Chloroplast_tree.tre、Concatenation_tree.tre、MPEST_population.tre、MPEST_Speciestree.tre、Helianthus_Species_branchlengths.nwk、Helianthus_population_branchlengths.nwk
- 文件格式：TRE、NWK
- 字段映射介绍：包含样本树、叶绿体树、合并分析树、联合分析物种树等，部分文件记录分支长度信息，反映物种间进化关系与分化程度。
- 序列文件（.fasta格式）
- 文件名称：Helianthus_chloroplast.fasta、Helianthus_concated_nDNA.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：分别存储向日葵属叶绿体DNA序列及核DNA串联序列，用于系统发育分析的基础数据。
- 压缩文件（.zip格式）
- 文件名称：Helianthus_fasta.zip、bootstrap_genetrees.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含FASTA序列压缩包及自展基因树压缩包，提供原始序列与分析中间结果。
数据来源
论文“Species tree estimation of diploid Helianthus (Asteraceae) using target enrichment”
适用场景
- 植物系统发育研究：分析向日葵属物种间的进化关系、分支划分及系统发育冲突。
- 进化生物学分析：探究向日葵属生命史、生长形态的演化过程及驱动因素。
- 遗传多样性研究：基于核DNA与叶绿体DNA序列，解析物种遗传变异特征。
- 进化方法验证：比较合并与联合分析在复杂属系统发育估计中的应用效果。
- 农业植物资源研究：为向日葵属农业、园艺物种的亲缘关系与资源利用提供参考。
