数据集概述
本数据集围绕亨廷顿病（HD）的胶质分化缺陷展开，通过人胚胎干细胞（hESC）来源的胶质祖细胞（GPC）RNA测序及嵌合小鼠实验，探究突变亨廷顿蛋白（mHTT）对胶质分化的抑制作用，包含实验数据、图表及分析文件。
文件详解
该数据集包含多个目录和文件，具体说明如下：
- 主图表目录（Main Figures/）：按实验图表分类，包含各图表的原始数据、统计分析文件、图表图片及说明
- 示例文件：
- Main Figures/Fig7 - CD44 APC RNA-seq/DEGs CD44 FDR005 & GO Annotation FDR010.xlsx：Excel格式，包含差异表达基因（DEGs）及基因本体（GO）注释数据
- Main Figures/Fig7 - CD44 APC RNA-seq/countData_GeneaHD_CD44.txt：TXT格式，CD44阳性细胞的基因表达计数数据
- Main Figures/Fig7 - CD44 APC RNA-seq/HD_RNASeq_NormalizationAndDE_CD44.R：R语言脚本，用于RNA-seq数据标准化及差异表达分析
- Main Figures/Fig1 - CD140 GPC RNA-seq/Figure 1 - Main Genomics Figure - V5.3_073117.pdf：PDF格式，主图表图片文件
- Main Figures/Fig2 - Fold Change to CAG length correlation/CAG_to_FC_correlation.R：R语言脚本，用于CAG长度与表达 fold change 的相关性分析
- 补充图表目录（Supplementary Figures/）：包含补充图表的图片及说明文件
- 示例文件：
- Supplementary Figures/SupplFig3 - Allelic Series Reference/Overlaps to Allelic Series - 051518.xlsx：Excel格式，等位基因系列参考数据
- Supplementary Figures/SupplFig1 - DEGs Sets Intersects/FIG S1 UpSetR - HD Genea - 072618.pdf：PDF格式，差异表达基因集交集分析图表
适用场景
- 神经科学研究：分析亨廷顿病中胶质细胞分化缺陷的分子机制
- 转录组学分析：研究突变亨廷顿蛋白对基因表达的影响
- 细胞生物学研究：探究胶质祖细胞分化为少突胶质细胞和星形胶质细胞的调控通路
- 治疗靶点筛选：验证SOX10、MYRF等转录因子在修复亨廷顿病胶质分化缺陷中的作用
- 生物信息学分析：复现RNA-seq数据的标准化、差异表达分析及基因本体注释流程
