数据集概述
本数据集是Durrieu等人2022年发表于IScience的研究成果，包含基于光漂白后荧光恢复（FRAP）技术的单细胞核转运速率测量数据、分析代码及实验方案。研究揭示了同基因酵母群体中核转运速率的细胞间异质性及其来源，为理解核转运调控机制提供数据支持。
文件详解
该数据集由代码、数据、方法与协议三类文件组成，具体说明如下：
- 代码文件:
- NuclearFRAP R包: 用于单细胞FRAP实验拟合，包含NuclearFRAP_0.53.1.tar安装包及说明文档
- Matlab脚本: 用于FRAP实验数据模拟，如auto_posm_5F.m、myCostFunction_2F.m等
- R脚本: 用于数据可视化分析（含西班牙文注释），如2022_analysis_simulatedFRAPS.R、Analysis_scFRAPS.Rmd等
- 数据文件:
- 酵母FRAP实验原始数据: 涵盖YFP、Fus3-YFP等蛋白的FRAP实验数据，如levData.txt、lev08.stk.jpg等
- FRAP拟合结果: NuclearFRAP包输出的实验数据拟合结果
- 模拟FRAP数据: 不同信噪比下的模拟原始数据及拟合参数结果，如simdata_snr1_10F_rep5.mat、results_1F_rep8snr1.mat等
- 核孔复合物蛋白定量数据: Mpl1-GFP等蛋白的共聚焦图像定量原始数据，如comparacion.RData
- Ace2蛋白FRAP实验数据: Crm1*处理酵母的FRAP实验原始数据，如lev01-time-series.xls
- 方法与协议文件:
- 实验室操作协议: FRAP实验及核孔复合物定量的实验方案（西班牙文），如Informe Medición de Proteínas Nucleares.pdf
数据来源
Durrieu et al. (IScience, 2022)
适用场景
- 细胞生物学研究: 分析单细胞水平核转运速率的异质性及其调控机制
- 生物信息学分析: 复现FRAP实验数据拟合与可视化流程
- 分子遗传学研究: 探究核孔复合物数量对核转运效率的影响
- 酵母细胞不对称分裂研究: 解析Ace2转录因子母-子细胞定位差异的分子机制
- 生物物理模型验证: 验证核转运相关生物物理模型的准确性
