数据集概述
本数据集包含用于Hidalgo-Villeda等人论文中微生物组分析的16S rRNA测序原始fastq文件及元数据表，共77个文件。内容为末端回肠和盲肠内容物的微生物组测序数据，测序分别在法国马赛地中海感染大学医院研究所和里尔Genoscreen完成，元数据表记录各fastq文件的描述与对应关系。
文件详解
- 测序数据文件（fastq.gz）
- 文件名称：包含编号文件（如37.fastq.gz、36.fastq.gz）和样本命名文件（如M7058_S91_L001_R2_001.fastq.gz等）
- 文件格式：fastq.gz（压缩fastq格式）
- 字段映射介绍：16S rRNA测序原始数据，包含末端回肠和盲肠内容物的微生物组测序读段信息
- 元数据文件
- 文件名称：metadata.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录各fastq文件的描述及对应关系，用于关联测序数据与样本信息
数据来源
论文"A physiological mouse model of severe acute malnutrition reveals prolonged dysbiosis and altered immunity under nutritional intervention, Hidalgo-Villeda et al."
适用场景
- 微生物组多样性分析：通过16S rRNA测序数据解析末端回肠和盲肠内容物的菌群结构与组成
- 营养不良相关菌群研究：结合论文研究背景，分析严重急性营养不良小鼠模型的肠道菌群失调特征
- 测序数据标准化处理：作为原始测序数据用于微生物组分析流程的方法验证与优化
- 多机构测序数据对比：对比法国马赛和里尔两地测序机构的16S rRNA测序数据质量差异
- 微生物组与免疫关联研究：支撑营养不良状态下肠道菌群与免疫功能改变的关联分析
