数据集概述
本数据集基于人类粪便样本的HiFi宏基因组测序,包含从五个样本中组装得到的一百零二个人类肠道微生物完整宏基因组组装基因组(cMAGs)相关数据,涵盖基因组序列、GC偏斜模式图、覆盖度图谱及元数据,为肠道微生物研究提供高质量基因组资源。
文件详解
- 文件名称:cMAG_metadata.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含一百零二个人类肠道微生物完整宏基因组组装基因组(cMAGs)的元数据信息,具体字段未提供预览
- 文件名称:102_cMAGs_fna.tar.gz
- 文件格式:TAR.GZ(压缩包)
- 字段映射介绍:包含一百零二个人类肠道微生物完整宏基因组组装基因组(cMAGs)的Fasta格式序列文件
- 文件名称:gc_skew_figures.tar.gz
- 文件格式:TAR.GZ(压缩包)
- 字段映射介绍:包含一百零二个人类肠道微生物完整宏基因组组装基因组(cMAGs)的GC偏斜模式图,内部文件为SVG格式
- 文件名称:coverage_plots.tar.gz
- 文件格式:TAR.GZ(压缩包)
- 字段映射介绍:包含一百零二个人类肠道微生物完整宏基因组组装基因组(cMAGs)的基因组覆盖度图谱文件
数据来源
标题为“HiFi Metagenomic Sequencing Enables Assembly of Accurate and Complete Genomes from Human Gut Microbiota”的研究
适用场景
- 肠道微生物基因组学研究: 利用高质量cMAGs序列分析人类肠道微生物的基因组结构与功能
- 微生物多样性分析: 通过基因组数据探究人类肠道微生物群落的物种组成与多样性特征
- 基因组特征研究: 结合GC偏斜模式图分析微生物基因组的结构特征及进化线索
- 测序覆盖度分析: 利用覆盖度图谱研究宏基因组测序数据对肠道微生物基因组的覆盖情况及组装质量评估