数据集概述
本数据集为HIV潜伏与激活感染细胞转录异质性研究的补充数据，包含SAHA和TCR处理细胞的GFP表达定量分析、单细胞及 bulk RNA-Seq数据计算分析结果，涉及荧光图像、序列文件、表达量数据等390份文件，支持HIV潜伏细胞转录特征与激活机制的研究。
文件详解
- 荧光图像文件
- 文件名称：遵循
smart[编号]_s[编号]_[放大倍数]_[处理条件]_[成像类型].TIF模式（如smart34_s31_10X_SAHA_GFP.TIF）
- 文件格式：TIF
- 字段映射介绍：包含SAHA/TCR处理细胞的GFP荧光成像（GFP后缀）与明场成像（BRIGHT后缀），共384份，记录不同处理条件下细胞的荧光表达情况
- 定量分析文件
- 文件名称：
Fluorescence_quantification_TCR_SAHA_ImageJ_RAW.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：ImageJ软件生成的TCR、SAHA处理细胞GFP荧光定量原始数据
- 序列与表达量数据文件
- 文件名称：Zenodo_Data_S1_HIV_GFP_VSVG_sequence.fa、Zenodo_Data_S2_SC_norm_exprs_model.rdata、Zenodo_Data_S3_SC_norm_exprs_donors.rdata
- 文件格式：FA、RDATA
- 字段映射介绍：包含HIV GFP VSVG序列（FA）、单细胞标准化表达量模型数据（RDATA）、供体来源单细胞标准化表达量数据（RDATA）
- 说明文档
- 文件名称：ReadMeFile1_GFPanalysis.txt、ReadMeFile2_Data_S1toS3.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：GFP分析说明文档、数据S1-S3说明文档
数据来源
论文“Single-Cell RNA-Seq Reveals Transcriptional Heterogeneity in Latent and Reactivated HIV-infected Cells”（Cell Reports，doi:10.1016/j.celrep.2018.03.102）
适用场景
- HIV潜伏感染机制研究: 分析潜伏与激活HIV感染细胞的转录异质性特征
- 抗病毒药物效果评估: 研究SAHA、TCR处理对HIV潜伏细胞激活及GFP表达的影响
- 单细胞转录组数据分析: 利用标准化表达量数据探索HIV感染细胞的基因表达模式
- 荧光成像定量研究: 基于ImageJ定量数据与荧光图像，分析HIV感染细胞的GFP表达定量特征
