数据集概述
本数据集为金鳞鱼科（Holocentridae）的分子系统发育研究数据，包含超半数已知物种的多单拷贝核基因与线粒体基因DNA序列数据，用于构建该科首个物种级系统发育树，解决其分类混乱问题，支持亚科单系性及内部类群关系的新假说。
文件详解
- UCLN_ALL_StarBEAST.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：用于StarBEAST分析的配置文件，包含金鳞鱼科物种的分子数据及分析参数设置
- RLC_ALL_StarBEAST2.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：用于StarBEAST2分析的配置文件，涉及金鳞鱼科系统发育分析的相关参数与数据配置
- All_holocentrid_ML.phy
- 文件格式：PHY
- 字段映射介绍：金鳞鱼科所有物种的最大似然法（ML）系统发育分析用序列数据文件
- All_holocentrid_MB2.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：金鳞鱼科物种的贝叶斯系统发育分析（MB2）用序列数据文件
数据来源
论文“Molecular phylogenetics of squirrelfishes and soldierfishes (Teleostei:Beryciformes: Holocentridae): reconciling more than 100 years of taxonomic confusion”
适用场景
- 鱼类分类学研究：用于解析金鳞鱼科的进化关系，解决其分类混乱问题
- 生物系统发育分析：支持构建物种级系统发育树，验证类群单系性假说
- 分子进化研究：分析核基因与线粒体基因在金鳞鱼科进化中的作用
- 分类学特征演化分析：通过祖先状态重建，研究分类诊断特征的复杂演化历史
