数据集概述
本数据集围绕家鼠遗传水平的强化信号研究,采用 hitchhiking 作图和候选基因方法,针对欧洲两个亚种杂交区的性隔离相关基因展开分析。包含微卫星基因分型原始数据及行为实验数据,共6个文件,用于检测近期选择事件的遗传特征。
文件详解
- 文件名称:Primer_information.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含实验所用引物的相关信息,可能涉及引物序列、目标基因位点等内容
- 文件名称:Genotyping_raw_data_for_HI_estimation.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:用于杂合度指数(HI)估算的基因分型原始数据,记录家鼠样本的基因型信息
- 文件名称:Genotyping_raw_data_pooling_validation_experiment.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍: pooling验证实验的基因分型原始数据,用于验证实验设计的可靠性
- 文件名称:Genotyping_raw_data_outlier_validation_experiment.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:异常值验证实验的基因分型原始数据,用于筛选和验证数据中的异常位点
- 文件名称:Genotyping_raw_data_main_experiment.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:主实验的基因分型原始数据,是研究遗传强化信号的核心数据
- 文件名称:Behavioural data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:家鼠行为实验数据,可能包含配偶选择实验中的气味偏好、交配行为等记录
数据来源
论文“Seeking signatures of reinforcement at the genetic level: a hitchhiking mapping and candidate gene approach in the house mouse”
适用场景
- 遗传强化机制研究:分析家鼠杂交区性隔离相关基因的选择信号,验证遗传水平的强化过程
- 分子进化分析:利用微卫星位点数据研究近期选择事件对基因组多样性的影响
- 行为遗传学关联:结合行为数据与基因分型数据,探索嗅觉偏好等交配行为的遗传基础
- 实验设计验证:通过pooling和异常值验证实验数据,优化遗传实验的设计与分析方法
- 候选基因筛选:基于基因分型结果,筛选参与家鼠性隔离的潜在候选基因并开展后续验证