数据集概述
本数据集为基于荧光偏振的“高通量甲基读取”(HTMR)实验数据,用于DNA/RNA甲基转移酶和去甲基化酶的大规模化合物筛选。包含实验设计、原始数据、分析结果等44个文件,涉及酶活性检测、IC50测定、竞争实验、热位移分析等内容,支持表观遗传治疗相关的药物筛选研究。
文件详解
- 实验说明文件
- 文件名称:Readme_XiaoSenhao.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:实验相关说明文档,可能包含实验设计、操作步骤、数据说明等信息
- 原始数据压缩包
- 文件名称:Thermal_Shift_QUERCETIN-ALKBH5_RAWDATA.rar、HPLC_RAWDATA.rar、MBD1_LINEARG_REGRESSION_with_enzymes_RAWDATA.rar、Counter_Screen-SGI1027-IC50_RAWDATA.rar、NMR-Quercetin.rar
- 文件格式:RAR
- 字段映射介绍:包含热位移、HPLC、线性回归、竞争实验、NMR等实验的原始数据
- 分析结果文件
- 文件名称:DNMT1_IC50_SAH_and_EA.pzf、Counter_Screen-cpd1.pzf、TET2_IC50_IOX1_and_Quercetin.pzf、MBD1_LINEARG_REGRESSION_with_enzymes.pzfx、Km_of_DNMT1_TET2_METTL_ALKBH5.pzfx、GST-YTHDF1_LINEARG_REGRESSION_with_Enzyme.pzfx、METTL_SAH_COMPETETION.pzf、Counter_Screen-SGI1027-IC50.pzf、ALKBH5_2-OG_COMPETETION.pzf
- 文件格式:PZF、PZFX
- 字段映射介绍:包含酶的IC50测定、线性回归分析、Km值测定、竞争实验等分析结果
适用场景
- 表观遗传药物筛选: 用于DNA/RNA甲基转移酶和去甲基化酶的抑制剂筛选,支持癌症治疗相关药物研发
- 酶活性检测: 分析甲基转移酶和去甲基化酶的活性,研究其催化特性
- 化合物作用机制研究: 通过竞争实验、热位移分析等数据,探究化合物对酶的作用机制
- 实验方法优化: 基于HTMR实验数据,优化表观遗传学相关酶的高通量检测方法