数据集概述
本数据集为美国黄石国家公园Lemonade Creek微生物群落分析的代谢组学数据,包含靶向与非靶向极性代谢组学数据,用于分析微生物群落在昼夜周期中的功能。数据集涵盖正负电离模式下的代谢物鉴定结果、峰高数据及质量验证文件,共9个文件。
文件详解
- 靶向代谢组学文件
- 文件名称:
NEG_506963_FinalEMA-HILIC_Identifications.xlsx、POS_506963_FinalEMA-HILIC_Identifications.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:由美国联合基因组研究所(Joint Genome Institute)制备,包含负/正电离模式下靶向代谢物的鉴定质量和置信度结果
- 文件名称:
NEG_peak_height.tab、POS_peak_height.tab
- 文件格式:TAB
- 字段映射介绍:负/正电离模式下靶向代谢物的峰高数据,为丰度分析的主要结果文件
- 文件名称:
NEG_msms_mirror_plots.tar.gz、POS_msms_mirror_plots.tar.gz
- 文件格式:GZ(压缩包)
- 字段映射介绍:负/正电离模式下靶向代谢物的MS/MS镜像图压缩文件
- 非靶向代谢组学文件
- 文件名称:
NEG_peak_height.csv、POS_peak_height.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:负/正电离模式下非靶向代谢物的峰高数据,包含row ID、row m/z、row retention time及各样本峰高值
- GNPS对比文件
- 文件名称:
GNPS_positive-2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:用于主代谢物分析的GNPS数据与靶向代谢物特征的对比文件,支持靶向集外代谢物鉴定结果的准确性验证
适用场景
- 微生物群落功能分析:通过昼夜周期代谢组学数据研究Lemonade Creek微生物群落的代谢功能动态
- 代谢物鉴定质量验证:利用靶向代谢物鉴定结果和MS/MS镜像图验证代谢物鉴定的准确性
- 靶向与非靶向代谢组学对比:通过GNPS数据对比分析靶向与非靶向代谢组学结果的一致性
- 环境微生物代谢组学研究:探究黄石国家公园特殊环境中微生物的代谢特征及环境适应性