环境DNA与占据模型估算广域集合种群动态数据集

数据集概述

本数据集结合环境DNA(eDNA)调查与动态空间多尺度占据模型,分析加州特有濒危物种潮汐虾虎鱼的广域集合种群动态。包含2016-2017年190个隔离位点的eDNA数据及模型代码,用于探究物种分布、灭绝与定殖概率及驱动因素。

文件详解

  • 代码文件:
  • AnalysisOfGobyData.R:R语言脚本,用于潮汐虾虎鱼数据的分析
  • DynamicOccModel.mcmcFuncs.R:R语言脚本,包含动态占据模型的MCMC函数
  • dMvnCpp.cc:C++代码文件,可能用于多变量正态分布计算
  • DynamicOccModelFuncs.cc:C++代码文件,包含动态占据模型的辅助函数
  • 数据文件:
  • Neighborhood_MatrixV6.3.csv:CSV格式,包含位点间距离矩阵数据,字段有Var1、Var2、value(距离值)
  • TWGeDNA_2016_2017.csv:CSV格式,2016-2017年潮汐虾虎鱼eDNA数据,字段包括siteID(位点ID)、season(季节)、lat/lon(经纬度)、pcr1-pcr6(PCR检测结果)等
  • 文档文件:
  • DataDictionary.pdf:PDF格式,数据字典,说明数据集各字段含义

适用场景

  • 保护生物学研究:分析濒危物种集合种群动态与分布变化
  • 环境DNA技术应用:评估eDNA在广域物种监测中的有效性
  • 生态学建模:验证动态空间多尺度占据模型在种群研究中的适用性
  • 环境管理:为加州潮汐虾虎鱼的栖息地保护与恢复提供数据支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.28 MiB
最后更新 2025年12月11日
创建于 2025年12月11日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。