数据集概述
该数据集围绕西西里岛与意大利半岛间蝴蝶线粒体COI基因遗传分化展开,整合84种蝴蝶的DNA序列、13项功能性状数据及气候、风速等环境约束信息,分析狭窄海峡对蝴蝶母系遗传分化的影响机制,包含多类型数据文件支持研究。
文件详解
该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下:
- 基因序列文件:
- reference_sequences_r1.fas、sequences_Sic_Cal.fas: 可能为FASTA格式的参考序列与西西里-卡拉布里亚地区蝴蝶COI基因序列文件。
- Nymphalis_polychloros.asc、Satyrium_ilicis.asc等.asc格式文件: 可能为特定蝴蝶物种的基因序列或分析结果文件。
- 空间数据文件:
- Italy.shp、Tunisia.shp、TM_WORLD_BORDERS-0.3.shp等.shp格式文件: 世界及意大利、突尼斯等地区的矢量边界数据。
- Italy.prj、Tunisia.prj等.prj格式文件: 空间参考系统信息文件。
- Italy.dbf、Tunisia.dbf等.dbf格式文件: 空间数据属性表文件。
- Italy.shx、Tunisia.shx等.shx格式文件: 空间数据索引文件。
- Nymphalis_polychloros_points.txt、Thymelicus_lineolus_points.txt等.txt格式文件: 包含蝴蝶分布点的经纬度信息,字段如Longitude(经度)、Latitude(纬度)。
- 分析代码文件:
- Appendix_S2_GTR.R、Appendix_S2.R、map_records.R等.R格式文件: R语言分析脚本,用于数据处理与可视化。
- 辅助文件:
- read.me.rtf: RTF格式的说明文档。
- Butterflies_Europe_tree_ultrametric.nwk: 蝴蝶系统发育树文件。
- Euchloe_ausonia__occurrence.jpg、Muschampia_proto_2trend.jpg等.jpg格式文件: 蝴蝶分布或趋势图图片。
- map.tif: TIFF格式的地图文件。
适用场景
- 进化生物学研究: 分析蝴蝶母系遗传分化机制与地理隔离的关系。
- 功能性状生态学研究: 探究蝴蝶功能性状(如翼展、食性泛化程度)对遗传分化的影响。
- 环境约束分析: 研究风速、气候适宜性等环境因素对蝴蝶扩散与遗传结构的作用。
- 生物地理学研究: 揭示地中海岛屿蝴蝶种群的特有性与残遗性特征。
- 空间生态学分析: 结合GIS数据开展蝴蝶分布与遗传多样性的空间格局研究。