数据集概述
本数据集整合形态学与DNA序列数据，通过尖端定年（TD）和化石化生死过程（FBD）模型，推断现生及灭绝狐猴的系统发育关系与分化时间，涉及马达加斯加特有狐猴88%的类群，为灵长类演化历史研究提供支持。
文件详解
- 系统发育树文件（.tre/.tree格式）：包含1000fbd421trees.tre、PCT_rooted.tre、RAxML_bestTree_total_evidence.tree等13个文件，存储不同模型或分析得到的系统发育树结构
- 图表文件（.pdf格式）：包含PCT w CFs.pdf、RaxML tree w bootstraps.pdf等13个文件，呈现节点年龄估计、RF距离箱线图、带支持度的系统发育树等可视化结果
- 分子与形态数据集文件（.nex格式）：包含Concatenated molecular dataset w gene partitions.nex、OSM File S1. Full 421 character morphological data matrix.nex等4个文件，存储分子序列分区数据、完整/简化形态数据矩阵及分析模块
- 辅助数据与代码文件：
- OSM File S4. Morphological data sources GenBank accession numbers and dataset tabulations.xlsx：Excel格式，记录形态数据来源、GenBank登录号及数据集制表
- OSM File S2. Character dissimilarity analysis code.txt：TXT格式，含字符 dissimilarity分析的R代码
- Online Supplemental Materials.docx：Word格式，提供在线补充材料说明
适用场景
- 灵长类演化研究：分析狐猴系统发育关系、分化时间及演化节奏
- 分子与形态联合分析方法验证：对比尖端定年（TD）与化石化生死过程（FBD）模型的结果差异
- 古生物数据整合应用：探究现生及灭绝物种数据结合对系统发育推断的影响
- 生物信息学方法实践：基于提供的R代码复现字符 dissimilarity分析流程
