数据集概述
本数据集基于微卫星数据,用于测试内华达山脉趾间蝾螈(Hydromantes)的避难所隔离、种群扩散及连通性模型,分析更新世冰川作用对其遗传多样性的影响。包含基因型数据与模型分析结果,共11个文件,以压缩包和文本文件为主,支持种群遗传学假设验证与遗传结构研究。
文件详解
- 基因型数据文件(TXT格式)
- 文件名称:Hydro_genotypes_GENEPOP_HpSOV.txt、Hydro_msats_Structure_HpNHb.txt、Hydro_msats_Structure_HpSOV.txt、Hydro_genotypes_GENEPOP_HbHpN.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含Hydromantes不同谱系(如platycephalus southern lineage)的10个微卫星位点基因型数据,记录种群编号、样本ID及各位点等位基因信息(如CC01样本的C109位点为257/261)
- 模型分析压缩包(ZIP格式)
- 文件名称:MSVAR.zip、ABCrun_Model1wpopchange.zip、ABCrun_Model2.zip、ABCrun_Model3.zip、ABCrun_Model4.zip、ABCrun_Model5.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含种群遗传学模型分析结果,涉及避难所隔离、种群连通性等假设的ABC(近似贝叶斯计算)与MSVAR(种群动态模拟)分析数据
适用场景
- 种群遗传学研究: 分析山地蝾螈种群的遗传结构、连通性及避难所隔离模式
- 冰川作用对物种影响分析: 探究更新世冰川作用对温带高山生物遗传多样性的塑造过程
- 生物迁移模型验证: 测试避难所扩张、隔离分化等种群动态模型的合理性
- 气候变化风险评估: 基于低扩散能力物种的遗传结构,评估其对气候变化与栖息地退化的响应风险