IAN_Based_转录组学数据集评估_性能测试数据

数据集概述

本数据集包含用于评估IAN性能的两个已发表RNA-Seq转录组学数据集,分别来自葡萄膜炎患者与健康对照的差异表达基因(DEG)研究,以及贝赫切特病(BD)患者与健康对照的原始RNA-Seq数据。数据经标准化整理,用于支持生物信息学工具性能验证,共包含4个文件。

文件详解

  • 文件名称:uveitis-PIIS0002939421000271-deg.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含葡萄膜炎研究中的差异表达基因ID列表,每行一个基因ID(如ENSG00000231535)。
  • 文件名称:uveitis-PIIS0002939421000271-table3-4.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:葡萄膜炎研究的补充表格,推测包含研究设计、统计结果等结构化数据(具体字段未完全展示)。
  • 文件名称:GSE198533_metadata.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段映射介绍:贝赫切特病研究的样本元数据,包含id(样本编号)、group(分组:HC健康对照/BD患者)等字段。
  • 文件名称:GSE198533_Raw_gene_counts_matrix.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段映射介绍:贝赫切特病研究的原始基因表达矩阵,包含gene_id(基因ID)、HC1_count至BDV5_count(各样本的基因计数)等字段。

适用场景

  • 生物信息学工具性能评估: 用于测试和验证IAN在转录组学数据分析中的准确性和效率。
  • 差异表达基因研究: 分析葡萄膜炎与贝赫切特病中的基因表达差异,探索疾病分子机制。
  • 转录组学数据标准化: 作为基准数据集,支持RNA-Seq数据预处理流程的优化。
  • 生物信息学算法开发: 为转录组学数据分析工具的开发提供测试数据。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 11.04 MiB
最后更新 2026年1月31日
创建于 2026年1月31日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。