数据集概述
本数据集包含支持论文“Idiosyncratic responses to biotic and environmental filters in wood-inhabiting fungal communities”的生物信息分析数据、脚本及流程。可用于复现研究结果,涉及木质生真菌群落对生物与环境过滤因素的特异性响应分析,共含9个文件,涵盖文档、代码、压缩包等类型。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称:README.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含所有文件的详细描述说明
- 代码文件(共5个,格式均为R)
- 文件名称:S1_define_models.R、S2_fit_models.R、S3_show_model_comparison.R、S4_show_effects.R、S5_show_variance_partitionings.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:分别对应模型定义、模型拟合、模型比较展示、效应展示、方差分解展示的分析脚本
- 压缩包文件(共2个,格式均为ZIP)
- 文件名称:deadwood_priority_effects.zip、optimotu_v0.6.4.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含死木优先效应相关数据及optimotu工具包
- 其他文件
- 文件名称:data_meta_otu.Rdata
- 文件格式:RData
- 字段映射介绍:包含元数据与OTU数据的R数据对象
数据来源
论文“Idiosyncratic responses to biotic and environmental filters in wood-inhabiting fungal communities”
适用场景
- 真菌生态学研究:分析木质生真菌群落对生物与环境过滤因素的特异性响应机制
- 生物信息学流程复现:复现研究中的模型构建、效应分析、方差分解等生物信息分析步骤
- 微生物群落数据分析:利用提供的OTU数据与元数据开展木质生真菌群落结构相关研究
- 生态过滤机制研究:探索环境与生物因素对真菌群落组装的过滤效应及优先级差异