数据集概述
本数据集包含从IMC（成像质谱流式）示例数据中提取的单细胞信息，涉及空间实验对象、图像及分割掩码等数据文件，支持IMC数据分析流程，为相关生物图像处理与分析提供数据基础。
文件详解
- gated_cells.zip: .zip格式，包含存储手动门控细胞的SpatialExperiment对象，基于细胞表达值获取真实细胞表型标签。
- spe.rds: .rds格式，SpatialExperiment对象，包含单细胞信息（每细胞每通道平均强度、细胞元数据、通道元数据）。
- images.rds: .rds格式，CytoImageList对象，包含溢出校正后的图像数据。
- masks.rds: .rds格式，CytoImageList对象，包含分割掩码数据。
数据来源
zenodo.org/record/5949116
适用场景
- 生物图像处理研究：分析成像质谱流式数据的单细胞空间信息。
- 细胞表型分析：基于手动门控细胞数据验证细胞表型分类模型。
- 生物信息学方法开发：支持SpatialExperiment、CytoImageList等对象的数据分析流程优化。
- 医学图像分析：探究单细胞成像数据在疾病研究中的应用。
