数据集概述
本数据集为ImmunoCluster工具配套的开发测试数据,包含免疫分析相关的处理后数据文件,支持高维质谱流式(CyTOF)和流式细胞术的免疫分析研究。数据来自Github仓库,包含FCS数据、元数据文件及初始化的SingleCellExperiment对象,共7个文件。
文件详解
- Github walkthrough数据
- fcs_data.zip:经过门控清理的.fcs数据文件,格式为ZIP
- panel_metadata.rds:CyTOF染色面板元数据RDS对象,格式为RDS
- panel_metadata.xlsx:CyTOF染色面板元数据Excel文件,格式为XLSX
- sample_metadata.rds:CyTOF患者元数据RDS对象,格式为RDS
- sample_metadata.xlsx:CyTOF患者元数据Excel文件,格式为XLSX
- sce_gvhd.rds:初始化的ImmunoCluster SingleCellExperiment对象,格式为RDS
- Full processed dataset
- FR-FCM-Z244_gated.zip:完整的门控数据集,包含经过门控清理的.fcs文件和元数据Excel文件,格式为ZIP
数据来源
https://github.com/kordastilab/ImmunoCluster
适用场景
- 免疫分析工具开发测试:用于ImmunoCluster工具的功能验证和性能测试
- 高维质谱流式数据分析:支持CyTOF数据的免疫分型和细胞亚群分析
- 流式细胞术数据处理:提供经过门控清理的FCS数据,用于流式数据的下游分析
- 生物信息学研究:作为免疫分析相关算法开发的测试数据集,支持免疫组学研究
- 医学研究:通过患者元数据和染色面板数据,辅助免疫相关疾病的机制研究