数据集概述
本数据集围绕奇努克鲑鱼近交对基因特异性DNA甲基化的影响展开，涵盖22个生长、代谢、免疫及应激相关基因的甲基化分析结果，包含基因序列、原始测序数据及甲基化百分比数据三类文件，用于研究近交衰退的表观遗传调控机制。
文件详解
- 文件名称：Venney_et_al_geneseqs_bwameth.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含研究涉及的基因序列信息，用于DNA甲基化分析的基因靶点参考
- 文件名称：Venney_et_al_inbreeding_fastq.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 字段映射介绍：压缩存储的原始测序数据文件，包含奇努克鲑鱼近交相关的基因测序原始数据
- 文件名称：Venney_final_pct_meth_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含基因特异性DNA甲基化百分比数据，记录不同组织、年龄的奇努克鲑鱼在22个目标基因上的甲基化水平结果
数据来源
论文“Inbreeding effects on gene-specific DNA methylation among tissues of Chinook salmon”
适用场景
- 鱼类表观遗传学研究：分析近交对奇努克鲑鱼基因甲基化的靶向调控作用，探索近交衰退的表观遗传机制
- 脊椎动物近交衰退机制研究：验证脊椎动物中基于表观遗传的近交衰退现象，拓展近交效应的分子调控理论
- 基因甲基化年龄相关性分析：研究不同年龄奇努克鲑鱼基因甲基化水平的变化规律，及其与性成熟、环境应激的关联
- 鱼类组织特异性甲基化研究：对比不同组织的甲基化模式差异，为表观遗传研究中的组织选择提供参考依据
- 水产养殖分子育种应用：通过基因甲基化数据指导奇努克鲑鱼的遗传管理，优化养殖种群的遗传多样性维护策略
