数据集概述
本数据集是双特异性靶向降解治疗剂膜穿透构象动力学研究的补充数据,包含5个Excel文件,记录了3589种PROTACs的结构信息、分子特性、膜模拟细节及实验测量数据,支持论文图表的验证与扩展分析。
文件详解
- Molecular formula strings.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含3589种PROTACs的SMILES格式结构,按E3连接酶配体、连接子、POI配体亚结构拆分,及原始文献参考
- 2D Key experimental details.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录从2D结构计算的分子特性,对应论文表1
- 3D Key experimental details.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录从3D结构计算的分子特性,对应论文图2
- Membrane simulation details.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含PROTAC-膜模拟细节,对应论文图3-5
- Experimental key details.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含PROTAC-细胞膜相互作用的实验测量细节,对应论文图3、5
数据来源
论文“Conformational dynamics in the membrane penetration of bispecific targeted degrader therapeutics”(Inganäs et al.)
适用场景
- 药物分子结构分析: 利用SMILES格式结构及亚结构拆分数据,研究PROTACs的分子设计规律
- 分子特性与膜穿透关系研究: 通过2D/3D分子特性数据,分析结构对膜穿透能力的影响
- 膜模拟实验验证: 基于膜模拟细节数据,复现或扩展PROTAC-膜相互作用的模拟研究
- 药物膜相互作用实验分析: 结合实验测量数据,探究PROTAC与细胞膜相互作用的机制
- 药物研发数据支撑: 为双特异性靶向降解治疗剂的设计优化提供分子结构与实验数据参考