数据集概述
本数据集为《Benchmarking commonly used software suites and analysis workflows for DIA proteomics and phosphoproteomics》一文的源数据，包含支持主图和补充图重现的文件，涉及DIA蛋白质组学与磷酸化蛋白质组学的软件套件及分析工作流基准测试相关内容，总计55个文件。
文件详解
- 压缩文件（.zip）
- 文件示例：Fig2h-RecoveryRate-HF.txt.zip、SFig8a-CompQuantMethods-TIMS-DIANN.txt.zip、Fig2j-RecoveryRate-TIMS.txt.zip等
- 文件格式：.zip（共53个，占比96.36%）
- 内容说明：包含支撑论文图表的文本数据压缩包，涉及回收率、蛋白质计数、变异系数、绝对相对误差等分析结果
- Excel文件（.xlsx）
- 文件名称：Fig5cd.xlsx、SFig17bc.xlsx
- 文件格式：.xlsx（共2个，占比3.64%）
- 内容说明：支撑论文特定图表的表格数据文件
数据来源
iProX数据库（标识符IPX0004576001）
适用场景
- 蛋白质组学分析方法验证：用于复现DIA蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学软件套件及工作流的基准测试结果
- 生物信息学工作流优化：对比不同软件（如DIANN）在DIA数据处理中的性能差异
- 医学研究辅助分析：结合ct相关语义关键词，支撑临床蛋白质组学研究中的数据分析方法选择
- 学术论文图表重现：为相关研究提供主图和补充图的原始数据支撑
