ITAG2_3_Source_番茄基因组注释RDF图谱数据

数据集概述

本数据集为番茄基因组ITAG2.3版本的RDF图谱注释数据,由GFF文件转换生成。核心内容是番茄基因模型的语义化注释,通过RDF格式实现基因信息的结构化表达,支持生物信息学领域的语义查询与分析,仅包含一个压缩文件。

文件详解

  • 文件名称:Tomato_gene_model_20130213.rdf.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包内包含由番茄基因组ITAG2.3版本GFF注释文件转换而来的RDF图谱数据,语义关键词涵盖基因(gene)、模型(model),结构化存储番茄基因的注释信息。

数据来源

ftp://ftp.sgn.cornell.edu/genomes/Solanum_lycopersicum/annotation/ITAG2.3_release/

适用场景

  • 番茄基因组语义分析:利用RDF图谱的结构化语义信息,开展番茄基因功能、结构的关联查询与知识挖掘。
  • 生物信息学数据整合:作为标准化语义注释数据,支持与其他植物基因组数据的跨源整合分析。
  • 基因模型可视化:基于RDF格式的基因模型数据,实现番茄基因组注释信息的语义化可视化展示。
  • 农业分子生物学研究:为番茄品种改良、功能基因鉴定等农业分子生物学研究提供基础注释数据支持。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 5.53 MiB
最后更新 2026年1月30日
创建于 2026年1月30日
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